Каждый из кадетов имеет собственную историю, которая привела его в Куантико, раскрывающаяся одновременно с главной историей. Воспитанники проходят обучение под строгим руководством опытного агента американских спецслужб Лиама Оконнора, после неудачной любовной интрижки, пониженного до должности инструктора в школе ФБР. Среди главных героев – выпускник Куантико, агент ФБР Алекс Перриш, несправедливо обвинённая в причастности к террористической атаке. Пытаясь выследить виновных и очистить своё имя, она вынуждена скрываться. Собственное расследование приводит её к мысли, что преступление тесно связано с событиями, связанными с её обучением в школе в Куантико. Алекс пытается вспомнить обстоятельства своего кадетства и выявить террористов. Ей помогает агент ФБР под прикрытием Райан Бут, который ищет преступников внутри криминального сообщества, куда он был внедрён. Среди друзей Алекс также инструктор Куантико Миранда Шоу в свободное от работы время, помогающая подруге очистить своё имя от подозрений. Долгое время они жили самой обычной жизнью, но однажды они одновременно увидели видение насильственной гибели девушки по имени Анжелика.